不同版本的《借种》完整版结局各不相同，目前流传较广的三个知名版本结局如下：
豌豆荚著网络小说《借种》：该版本为圆满HE结局。男主暗恋女主多年，女主的丈夫因为自身不能生育，为了谋夺女主家族的家业，刻意设计安排男女主完成“借种”，男主顺势将计就计推进关系。事情败露后，男女主向彼此坦白了心意，男主帮助女主和作恶的丈夫顺利离婚，最终两人成功走到一起，收获圆满结局。
香港电影《灭门惨案II：借种》：该版本是彻头彻尾的悲剧结局。故事中夫妻因为丈夫无法生育选择借种，不料被担任借种方的村霸反复勒索凌辱，妻子不幸染上梅毒还被迫流产，丈夫找恶霸报仇反而被对方杀害。最终妻子亲手杀死恶霸完成复仇，但此时她已经失去了所有亲人与一切，在讲完全部经历后跳崖自尽，落得家破人亡的下场。
夏芊芊著东方玄幻小说《借种》：该版本为圆满结局。女主为了救被困的父亲被迫和男主发生关系，事后女主独自离开，五年后带着两人的孩子回国，男主很快寻到了女主母子，最终两人解开当年的误会走到一起，结局时女主还怀上了和男主的第二个孩子，整体结局圆满幸福。
