《星际争霸2》人族战役剧情围绕人类在科普卢星区的抗争与权力更迭展开，核心冲突涉及异虫入侵、联邦覆灭、泰伦帝国崛起及凯瑞甘的异化与救赎，具体可分为以下阶段：
故事始于人类殖民地玛·萨拉星，该星球因异虫入侵陷入混乱。联邦政府为保存军事力量，下令撤离军事人员，放任平民遭受虫群屠戮。联邦治安官吉姆·雷诺因不满联邦的冷漠，加入反联邦组织“克哈之子”，其领袖为阿克图尔斯·蒙斯克。克哈之子通过军事行动解救部分平民，但未能阻止玛·萨拉被异虫吞没。随后，星灵（Protoss）为遏制异虫扩散，以净化炮火彻底焚毁玛·萨拉，人类殖民地化为焦土。
玛·萨拉沦陷后，克哈之子转战安提加主星。雷诺与前联邦幽灵特工莎拉·凯瑞甘成为核心成员，二人高效协作对抗异虫。当异虫再次入侵时，蒙斯克提出使用“灵能发射源”吸引虫群攻击联邦军队。这一战术虽成功重创联邦，但导致大量平民伤亡。雷诺与凯瑞甘强烈反对，但蒙斯克坚持执行，并利用虫群对联邦首都塔桑尼斯发动总攻。星灵军队因虫群聚集而介入，蒙斯克趁机指使凯瑞甘阻击星灵，自己则洗劫塔桑尼斯，夺取联邦资源。
凯瑞甘曾暗杀蒙斯克的父亲，且多次质疑其命令，蒙斯克因此视她为威胁。在塔桑尼斯沦陷之际，蒙斯克故意抛弃凯瑞甘，任由她被异虫包围并感染。雷诺与追随者愤而退出克哈之子，盗取蒙斯克的旗舰休伯利安号，组建“雷诺的游骑兵”继续反抗。蒙斯克则利用联邦残余势力重组政府，建立泰伦帝国，自封皇帝，以铁腕统治科普卢星区。
异虫主脑“主宰”对凯瑞甘的灵能潜力产生兴趣，将其带回查尔行星并异化为刀锋女王。凯瑞甘成为首个保留自我意识的异虫个体，并通过灵能向雷诺求救。雷诺率领游骑兵前往查尔，同时星灵部队在执政官塔萨达尔指挥下也抵达该星球。人类与星灵短暂合作，试图阻止凯瑞甘完全沦为异虫工具，但最终未能逆转其异化进程。凯瑞甘的命运成为后续剧情的关键转折点，也为星区未来的冲突埋下伏笔。
剧情核心主题：人类在极端环境下的道德抉择、权力腐败的必然性，以及跨种族冲突的复杂性。雷诺的理想主义与蒙斯克的实用主义形成鲜明对比，而凯瑞甘的异化则象征个体在生存压力下的异化与救赎可能。
