中国5000年以前的古城主要包括良渚古城遗址、南佐遗址和石家河古城。
良渚古城遗址位于杭州，是中国最早的王城之一，距今约5300-4300年。其核心区以莫角山宫殿遗址为中心，拥有史前最大的宫殿基址（面积约30万平方米），城墙宽度达150米，为同时期遗址之最。池中寺粮仓出土20万公斤碳化稻谷，印证了高度发达的农业经济。良渚古城的水利系统规模宏大，由11条坝体构成，兼具防洪、灌溉与运输功能，是世界上最早的拦洪坝系统之一，展现了早期国家对自然资源的统筹能力。
南佐遗址位于甘肃庆阳西峰区，距今约5000年，属仰韶文化晚期。其核心区面积达600万平方米，中央宫殿式建筑室内面积330平方米，主室150多平方米，采用“九室一堂”布局，墙体经夯筑处理，地面涂抹白灰面，显示高等级建筑特征。出土的彩陶以白衣陶为主，纹饰复杂，部分陶器底部发现粟、黍等炭化粮食，反映农业与手工业的分工。遗址中轴对称的空间布局，暗示可能存在早期礼制或权力中心。
石家河古城位于湖北天门，距今约4800-4200年，是长江中游规模最大的史前城址，面积达350万平方米。古城由内城、外城和环城水系构成，水系兼具防御与灌溉功能，体现“城水共生”的规划理念。手工业以玉器制作最为突出，出土的“中华第一凤”玉佩、人神复合像等，工艺精湛，象征宗教权力。石家河文化与良渚、石峁并称“中华文明三大摇篮”，其青铜器残片、刻划符号等发现，为早期文字与冶金技术起源提供线索。
这三座古城分别代表了长江下游、黄河中游和长江中游的史前文明高峰，其规划理念、建筑技术与社会组织形式，为理解中国早期国家形成提供了关键证据。
