中央组织部下设多个部门，主要包括办公厅、党建研究室、组织局以及多个干部管理相关局室等，对外还保留国家公务员局牌子。具体如下：
中央组织部内设机构丰富，办公厅负责综合协调、文件运转等日常事务性工作，保障部内各项工作的有序开展；党建研究室专注于党的建设理论研究，为党建工作提供理论支持和决策参考；组织局承担着党组织建设、党员管理等方面的重要职责，对加强党的组织建设发挥着关键作用。
在干部管理方面，设有干部监督局，对干部选拔任用等工作进行监督，确保干部工作的公正性和严肃性；干部教育局负责干部的教育培训工作，提升干部的综合素质和能力；领导干部考试与测评中心则通过科学的考试和测评手段，为干部选拔提供客观依据。
干部调配局（干部一局）、党政与外事干部局（干部二局）、经济与科技教育干部局（干部三局）、中央与国家机关干部局（干部四局）、企业干部局（干部五局）分别针对不同领域、不同层次的干部进行管理和调配，以满足党和国家事业发展对各类干部的需求。
此外，老干部局负责做好老干部的服务和管理工作；人才工作局致力于人才政策的制定和实施，推动人才工作的发展；人事局负责部内的人事管理工作；直属机关管理局承担着部机关的后勤保障等职责；机关党委负责部机关的党建工作；全国组织干部培训中心开展组织干部的培训工作；党建研究所开展党建领域的研究工作。
同时，中央组织部对外保留国家公务员局牌子，其公务员管理相关职责由公务员一局、公务员二局、公务员三局承担，负责公务员的录用、考核、奖惩等管理工作。
