第1集：乾隆遇敌，蒙面女子救驾，陈文杰受命追捕徐莲和乾坤扇。陈文杰痛惩假冒官员。
第2集：陈青莲救乾隆后离开，留下乾坤扇，十公主离京，挑战陈文杰。公主欲接近乾隆。
第3集：公主挑衅陈青云，被制服后计划水上功夫，文杰和公主被卖，丰绅殷德与徐莲重逢。
第4集：文杰险入危机，徐莲救他未果，陈青云发现心远行踪，公主揭露尹三江案件。
第5-10集：陈文杰揭露人口贩卖和贪官，公主卷入，尹三江欲献徐莲，案件复杂化。
第11-20集：御花园争夺，陈文杰揭示“陈文静”身份，乾隆揭示和珅贪污。
第21-30集：中秋夜行动，世仇显现，陈文杰面临再次出战任务。
第31-40集：剧情转折，捉拿真凶，世仇与忠诚交织。
电视剧《少年大钦差》是《九岁县太爷》的续集，讲述的是天才儿童陈文杰智斗和申、惩处贪官、为民请命的故事，剧中的陈文杰最初是一个骄傲自负的天才儿童，经历了诸多“挫折教育”之后，成长为一个机智勇敢的大钦差。本剧有了曾志伟、吴孟达、张默和小叮当这老老小小四大喜剧天才的加入，使该剧变得幽默搞笑，但轻松过后传达给少年儿童的是一种健康正面、积极向上的精神内涵，加强他们的磨练意识，培养他们辨别是非的能力、对挫折的承受能力。
