《清宫计》的结局包含感情线与宫斗主线两大分支，共16种不同结局，具体如下：
感情线结局围绕四皇子胤祯、怀亲王玄哲、秦墨言三位可攻略角色展开，每位男主均设有入宫前后的不同走向，需通过特定选项触发：
宫斗主线结局涉及派系斗争、子嗣继承等复杂分支，核心角色结局如下：
若玩家帮助某角色远离深宫（如选择“假死脱身”或“联姻外族”），可触发“找到真爱”结局；
若角色在斗争中被牺牲（如卷入派系冲突未及时化解），则可能死亡；
若角色看透宫斗虚妄（如选择“出家”或“隐居”），可达成“遁世隐居”结局。
游戏通过16种结局强调“选择的重要性”，例如：
